哈爾濱海關(guān)為正局級直屬海關(guān)，下轄一個副廳級機(jī)構(gòu)和36個處級機(jī)構(gòu)，其中：哈爾濱海關(guān)內(nèi)設(shè)正處級機(jī)構(gòu)17個,副處級機(jī)構(gòu)1個；哈爾濱海關(guān)共有隸屬海關(guān)機(jī)構(gòu)18個。哈爾濱海關(guān)下設(shè)走私犯罪偵查分局（副廳級）。

哈爾濱關(guān)區(qū)所轄范圍為黑龍江省全境，面積為45.39萬平方公里，山川秀麗，物產(chǎn)豐富,邊境線長達(dá)3045公里，全部與俄羅斯接壤，是亞洲及太平洋地區(qū)陸路通往俄羅斯和歐洲大陸的重要通道。除哈爾濱經(jīng)濟(jì)技術(shù)開發(fā)區(qū)海關(guān)、齊齊哈爾海關(guān)、牡丹江海關(guān)、佳木斯海關(guān)、大慶海關(guān)以外，其余13個海關(guān)均為邊境口岸海關(guān)，其中包括我國最北端的漠河海關(guān)，最東端的撫遠(yuǎn)海關(guān)。中俄邊境小額貿(mào)易、邊民互市貿(mào)易是黑龍江省對外貿(mào)易的一大特色。哈爾濱海關(guān)設(shè)在哈爾濱市，她地處富饒的松嫩平原東端，美麗的松花江南岸，所轄阿城、尚志、雙城、五常4市和呼蘭、賓縣、方正、依蘭、巴彥、木蘭、通河、延壽8縣。

哈爾濱海關(guān)前身為哈爾濱關(guān)，建立于1907年，至今已有90多年的歷史。1946年前，被洋人所控制，屬于半殖民地性質(zhì)的海關(guān)，成為列強(qiáng)傾銷商品、掠奪中國財富，進(jìn)行經(jīng)濟(jì)侵略的工具。1946年哈爾濱解放后她才回到人民手中。哈爾濱海關(guān)的歷史，是中國海關(guān)從屈辱走向光榮的縮影，是中國從衰落走向強(qiáng)盛的歷史見證。

滄桑回首，時世變遷。從1980年恢復(fù)建制至今，哈爾濱海關(guān)已經(jīng)走過了20年的不平凡歷程。在海關(guān)總署的正確領(lǐng)導(dǎo)下，哈爾濱海關(guān)全體關(guān)員認(rèn)真貫徹黨的路線、方針、政策，堅持以鄧小平理論指導(dǎo)改革與發(fā)展的實(shí)踐，解放思想、銳意進(jìn)取，在履行海關(guān)監(jiān)管職能，促進(jìn)本地區(qū)對外經(jīng)濟(jì)貿(mào)易發(fā)展等方面做出了應(yīng)有的貢獻(xiàn)。今后，我們將嚴(yán)格貫徹“依法行政、為國把關(guān)、服務(wù)經(jīng)濟(jì)、促進(jìn)發(fā)展”的海關(guān)業(yè)務(wù)指導(dǎo)思想，堅持“從嚴(yán)治關(guān)”，加快通關(guān)作業(yè)改革步伐，加強(qiáng)海關(guān)干部隊伍建設(shè)，在建立社會主義市場經(jīng)濟(jì)體制，加快對外開放的大格局中發(fā)揮更大的作用。